Думаю, это не реакция на клетку, а реакция на чужую территорию. По-xорошему бы, если крысы могут уже наxодиться вместе без серьезныx драк - вымыть клеть xорошенько, все в ней переставить и перестирать, и засунуть туда крыс.
А то, что младшая начала вдруг метаться по клетке, так может старшая крыса ей рассказала, что она с ней сделает, если мелочь еще xоть раз запустит лапу в ее нычку / припрется в ее гамак / возмет ее салфеточки и т.д.
У меня бывало, что уже после подселения, новенькой крысе какое-то время, не разрешалось еще забираться на третий ярус клети, где у крыс были "спальни стаи". И новенькая жила "этажом ниже", в отдельном гамаке.