Ну, механизм передачи мегаколона всё еще не исследован. Возможно, он вообще не наследуется, а наследуется комбинация генов, при которой крыса остается здоровой. Стало быть, неизвестно, что опаснее: вязать здоровых однопометников или искать неродственных якобы "чистых".
Сейчас почти во всех питомниках аутбредные линии. Это значит, что в одном помете могут быть как шикарные звери (по любым параметрам), так и конкретно проблемные. Это сильно затрудняет выбор.
Если же по теме, то в провинции должен волновать не вопрос хозяев, а вопрос ветеринаров. Самке, не дай б-г, но может понадобиться срочная операция. Сможете за день-два это разрешить, если вдруг?